Por más que hoy parezca que estos principios, por provenir de lo que conocemos como “las ciencias exactas”, son irrefutables, en su momento Almeyda fue señalado por sus estudios enfocados en la filosofía de las ciencias, la ciencia experimental moderna y el empirismo inglés. Sobre sus detractores apuntaba “En una parte dicen que los modernos somos insolentes, que lo que dicen es desafuero, atrevimiento, injuria, escándalo, locura, delirio. Pues lo que se dice del autor de unos libritos de filosofía moderna aún es mucho peor. Mándanle que coja los libros y que los envíe a una tienda para envolver drogas..., en otra parte gritan aquí del rey contra él”.

 

Su obra extensa incluyó los once volúmenes de Reacción filosófica, los tres volúmenes de las cartas físico matemáticas y el título la Armonía de la razón y de la religión.